Olá Sara!
Começar com elevada taxa de germinação e com muitas plantas a crescer... nunca é "mau"!

Se está numa marquise e se tem boa exposição solar, pela experiência que acaba de descrever, sugiro que plante diretamente no local definitivo no futuro.
Quanto ao presente e o caso em questão, fica difícil avaliar o tamanho do teu tabuleiro por essa foto.... mas no máximo deixaria 2 ou 3 alfaces por cada oríficio que depois transplantaria. Assim sendo, cortaria as do meio e deixaria algumas perto das extremidades, para que seja menos provável estragar as raízes quando efetuar o transplante.
De qualquer forma, vale a pena referir que não tenho grande experiência e conhecimento na matéria. :)
Boa sorte.