Caro Ruben, pela foto e pelo que me diz, julgo tratar-se de larvas da mosca da cebola, que geralmente aparecem entre Maio e Agosto, e que destroem não apenas as raízes, como escavam túneis no interior da base do bolbo, e permitindo a entrada de podridões. Caso seja este problema, proteja as plantas semeadas ou plantadas, em Maio e Junho, tratando o solo com Diazinão ou com Clorpirifos em grânulos.
Caso de trate de simples lagartas (rosca), polvilhe as plantas com Carbaril ou com HCH, ou ainda em alternativa, com Fenitotião.